Uniwersytet Jagielloński w Krakowie - Punkt LogowaniaNie jesteś zalogowany | zaloguj się
katalog przedmiotów - pomoc

Panel: zaawansowane metody obliczeniowe i strukturalne

Informacje ogólne

Kod przedmiotu: WCh-SD03-19 Kod Erasmus / ISCED: (brak danych) / (brak danych)
Nazwa przedmiotu: Panel: zaawansowane metody obliczeniowe i strukturalne
Jednostka: Wydział Chemii
Grupy:
Punkty ECTS i inne: 0 LUB 3.00 (w zależności od programu)
zobacz reguły punktacji
Język prowadzenia: polski

Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2019/2020" (w trakcie)

Okres: 2020-02-24 - 2020-06-14
Wybrany podział planu:


powiększ
zobacz plan zajęć
Typ zajęć: Warsztat, 30 godzin więcej informacji
Koordynatorzy: Barbara Gil
Prowadzący grup: Michał Duda, Andrzej Eilmes, Krzysztof Lewiński, Wiesław Łasocha, Marcin Oszajca
Lista studentów: (nie masz dostępu)
Zaliczenie: Zaliczenie na ocenę
Pełny opis:

Część 1:

Prowadzący: dr hab. A. Eilmes, prof. UJ

Opis: Treści programowe:

• stabilność numeryczna algorytmów

• algebra liniowa

- rozwiązywanie układów równań liniowych; metody oparte na rozkładach trójkątnych

- rozkład macierzy według wartości osobliwych; rozwiązywanie nadokreślonych układów równań

- zagadnienie własne macierzy

- zagadnienia praktycznej implementacji na współczesnych architekturach komputerowych; biblioteki BLAS i Lapack

• rozwiązywanie równań i układów równań nieliniowych

• równania różniczkowe

- równania i układy równań różniczkowych zwyczajnych; układy sztywne

- przykłady rozwiązywania równań różniczkowych cząstkowych

• optymalizacja

- metoda sympleksów; metody gradientowe

- znajdowanie minimum globalnego; symulowane wyżarzanie; algorytmy genetyczne

Literatura

Obowiązkowa: D. Kincaid, W. Cheney, Analiza numeryczna, WNT

Uzupełniająca: Z. Fortuna, B. Macukow, J. Wąsowski, Metody numeryczne, WNT; dokumentacja dostępna w Internecie.

Część 2:

Koordynator: prof. dr hab. W. Łasocha

Opis: Klasyczne zastosowania to jakościowa i ilościowa analiza fazowa oraz wielkość krystalitów.

Wśród nowych zastosowań należy wymienić:

- Dyfrakcja proszkowa w warunkach zmiennych temperatur i ciśnień

- Badania w atmosferach gazów reakcyjnych (zastosowania w katalizie)

- Analiza tekstur (uprzywilejowana orientacja krystalitów)

- Pełne badania strukturalne

Potencjał badawczy zostanie zaprezentowany na bazie problemów materiałowych, badań katalitycznych, oraz badań obiektów zabytkowych.

Część 3:

Koordynator: prof. dr hab. K. Lewiński

Prowadzący: prof. dr hab. K. Lewiński, prof. dr hab. Wiesław Łasocha, dr hab Justyna Kalinowska-Tłuścik, dr Marcin Oszajaca, dr Marcin Kozieł

Opis: Wykorzystanie dostępnych baz struktur do budowy bloków używanych następnie do tworzenie modeli struktur krystalicznych w oparciu o metody semi-losowego przeszukiwania przestrzeni rzeczywistej. Wykorzystanie metody charge flipping do rozwiązywania struktur krystalicznych próbek polikrystalicznych.

Zaawansowane metody korzystania z baz CSD i PDB w analizie oddziaływań ligand-białko. Analiza trójwymiarowej struktury białka i kieszeni wiążącej ligand. Przygotowanie struktury targetu do procedur dokowania. Metody dokowania molekularnego, analiza funkcji oceny i możliwość weryfikacji zadokowanych póz. Określenie typów oddziaływań pomiędzy ligandem i aminokwasami kieszeni wiążącej.

Opisy przedmiotów w USOS i USOSweb są chronione prawem autorskim.
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Jagielloński w Krakowie.