Genetyka – praktyczne aspekty
Informacje ogólne
Kod przedmiotu: | WBNZ-976 | Kod Erasmus / ISCED: |
(brak danych)
/
(0511) Biologia
![]() |
Nazwa przedmiotu: | Genetyka – praktyczne aspekty | ||
Jednostka: | Instytut Zoologii i Badań Biomedycznych | ||
Grupy: |
Kursy zalecane w ścieżce kształcenia: biologia molekularna, II st. od r. ak. 2019/20 Przedmioty dla programu WBL-0011-2SO (Biologia 2 stopień; 1 rok + 2 rok) |
||
Punkty ECTS i inne: |
2.00 ![]() |
||
Język prowadzenia: | polski |
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2020/2021" (w trakcie)
Okres: | 2021-02-25 - 2021-06-15 |
![]() |
Typ zajęć: |
Ćwiczenia, 20 godzin ![]() Konwersatorium, 10 godzin ![]() |
|
Koordynatorzy: | Małgorzata Duda | |
Prowadzący grup: | Małgorzata Duda, Filip Gołębiowski | |
Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
Zaliczenie: | Przedmiot - Zaliczenie na ocenę | |
Ocena wliczana do średniej: | tak |
|
Cele kształcenia: | Zapoznanie studenta z diagnostyką onkologiczną, kryminalistyczną i stosowaną w badaniach żywności. |
|
Efekty kształcenia: | W zakresie wiedzy Student: zna wybrane metody izolacji kwasów nukleinowych (m.in. z zastosowaniem robotów laboratoryjnych); zna wybrane techniki i przykładową aparaturę pozwalającą na ocenę ilościową i jakościową wyizolowanych kwasów nukleinowych (metoda spektrofotometryczna, metoda elektroforezy kapilarnej); W zakresie umiejętności Student: prawidłowo obsługuje aparaturę specjalistyczną stosowaną w diagnostyce, w tym m.in. termocykler, robot do izolacji kwasów nukleinowych, spektrofotometr, aparat do elektroforezy kapilarnej; potrafi prawidłowo przeanalizować i zinterpretować wyniki przeprowadzonych analiz pod kątem: -typowania genetycznego metodą High Resolution Melting; -diagnostyki onkologicznej metodą analizy mutacji w wybranym onkogenie; -diagnostyki patogenów (np. identyfikacja i ocena miana wirusów); -przesiewowego badania ekspresji genów stosuje właściwe programy komputerowe służące do analizy wyników reakcji real-time PCR; wyszukuje przykłady i prowadzi dyskusję na temat najnowszych światowych osiągnięć w dziedzinie diagnostyki genetycznej; przestrzega procedur dotyczących obchodzenia się z materiałem biologicznym (w tym również zakaźnym). |
|
Wymagania wstępne: | brak |
|
Forma i warunki zaliczenia: | Ćwiczenia oceniane w sposób ciągły na podstawie przygotowania do zajęć zgodnie z harmonogramem (kolokwia tzw. wejściówki) oraz na podstawie raportów z ćwiczeń. Konwersatoria oceniane na podstawie kolokwiów ustnych. Warunkiem zaliczenia kursu jest: -ocena pozytywna każdego raportu, co będzie świadczyć o praktycznej znajomości poznanych technik; -uzyskanie co najmniej 60% wszystkich punktów możliwych do zdobycia w trakcie kolokwiów pisemnych i ustnych. |
|
Metody sprawdzania i kryteria oceny efektów kształcenia uzyskanych przez studentów: | W celu zaliczenia przedmiotu student powinien wykazać się praktyczną znajomością wszystkich stosowanych technik. Będzie to weryfikowane na podstawie uzyskanych wyników zamieszczonych w raporcie po zakończeniu każdego ćwiczenia. Wiedza uzyskana w trakcie kursu będzie weryfikowana podczas kolokwiów tzw. wejściówek na początku każdego ćwiczenia oraz kolokwiów ustnych w trakcie konwersatoriów. Efekty kształcenia w zakresie wiedzy zostaną osiągnięte jeśli student wymieni i scharakteryzuje przynajmniej dwie z przedstawianych metod izolacji kwasów nukleinowych; wymieni i scharakteryzuje aparaturę pozwalającą na ocenę ilościową i jakościową wyizolowanych kwasów nukleinowych metodą spektrofotometryczną; wymieni i scharakteryzuje przynajmniej jedną technikę oceny jakości i ilości kwasów nukleinowych. |
|
Metody dydaktyczne: | prezentacje multimedialne ćwiczenia laboratoryjne praca przy komputerze |
|
Bilans punktów ECTS: | Udział w konwersatoriach – 10 h Udział w ćwiczeniach – 20 h Przygotowanie do konwersatoriów (w tym: czytanie literatury fachowej) 10 h Przygotowanie do ćwiczeń (w tym: przygotowanie raportów) 15 h Suma: 55 h |
|
Grupa treści kształcenia: | Grupa treści kształcenia do wyboru |
|
Pełny opis: |
Zagadnienia poruszane w trakcie konwersatoriów: 1. Przedstawienie podstawowych zasad obchodzenia się z materiałem biologicznym (w tym również zakaźnym) na etapie przygotowania próbki do izolacji. 2. Zaprezentowanie podstawowych metod izolacji kwasów nukleinowych, z naciskiem na metodę kolumienkową. Zalety metody. 3. Przedstawienie technologii i przykładowej aparatury pozwalającej na ocenę ilościową i jakościową wyizolowanych kwasów nukleinowych metodą spektrofotometryczną. 4. Przybliżenie podstawowych metod amplifikacji DNA/RNA metodą qPCR. 5. Przedstawienie techniki oceny jakości i ilości kwasów nukleinowych przy pomocy elektroforezy kapilarnej. 6. Przedstawienie dedykowanych metod analizy i interpretacji przeprowadzonych reakcji. Techniki poznawane w trakcie ćwiczeń: 1. Obsługa wybranego robota laboratoryjnego służącego do izolacji kwasów nukleinowych – zasada działania, dobór odpowiedniego protokołu z menu urządzenia, prawidłowe przygotowanie i umieszczenie próbek, przygotowanie odczynników itd. 2. Nauka obsługi aparatury pozwalającej na ocenę ilościową i jakościową wyizolowanych kwasów nukleinowych metodą spektrofotometryczną. 3. Obsługa wybranego termocyklera – zasada działania, zaprogramowanie reakcji, przygotowanie i umieszczenie próbek w urządzeniu, analiza i interpretacja danych. 4. Obsługa wybranego aparatu do elektroforezy kapilarnej - zasada działania, zaprogramowanie reakcji, przygotowanie i umieszczenie próbek w urządzeniu, analiza i interpretacja danych. | |
Literatura: |
Literatura uzupełniająca Wybrane protokoły i metodyki wykonywania analiz oraz instrukcje obsługi aparatury, w tym: 1. RNeasy Mini Kit Handbook 2. QIAamp DNA Mini Kit 3. artus® CMV RG PCR Kit Handbook 4. artus® HCV RG RT-PCR Kit Handbook 5. therascreen® EGFR Plasma RGQ PCR Kit 6. Investigator ESSplex SE QS Handbook 7. RT2 Profiler PCR Array Handbook 8. Type-it HRM PCR Handbook - (EN) 9. Rotor-Gene Q User Manual 10. QIAxcel Advanced User Manual 11. QIAxpert User Manual 12. QIAcube User Manual | |
Uwagi: |
I rok, studia II stopnia; fakultatywny, zalecany dla ścieżki biologia organizmów |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Jagielloński w Krakowie.