Genetyka molekularna
Informacje ogólne
| Kod przedmiotu: | WBNZ-988-IK | Kod Erasmus / ISCED: |
(brak danych)
/
(0511) Biologia
 |
| Nazwa przedmiotu: | Genetyka molekularna | ||
| Jednostka: | Instytut Zoologii i Badań Biomedycznych | ||
| Grupy: |
Biologia: przedmioty dla programu WBNZ-n011-0-ZD-6 Przedmioty obowiązkowe dla III roku biologii (studia I stopnia) |
||
| Punkty ECTS i inne: |
4.00 |
||
| Język prowadzenia: | polski | ||
Zajęcia w cyklu "Semestr letni 2020/2021" (w trakcie)
| Okres: | 2021-02-25 - 2021-06-15 |
 
 zobacz plan zajęć |
| Typ zajęć: |
Ćwiczenia, 40 godzin  więcej informacji Konwersatorium, 10 godzin więcej informacji Wykład, 10 godzin więcej informacji |
|
| Koordynatorzy: | Paweł Grzmil | |
| Prowadzący grup: | Michał Duliban, Paweł Grzmil, Sylwia Herman | |
| Lista studentów: | (nie masz dostępu) | |
| Zaliczenie: | Przedmiot - Egzamin | |
| Ocena wliczana do średniej: | tak |
|
| Cele kształcenia: | Zapoznanie studentów z molekularnymi zagadnieniami związanymi z dziedziczeniem oraz aktywnością genów |
|
| Efekty kształcenia: | Po ukończeniu kursu student zna takie zagadnienia jak: molekularna organizacja materiału genetycznego (sekwencje kodujące, niekodujące, regulatorowe i ich funkcje), molekularne podstawy wraz z zaangażowanymi enzymami takich procesów jak: replikacja, transkrypcja i translacja; molekularne mechanizmy kontroli tych procesów, funkcję RNA (kodującego jak i niekodującego), metody badania ekspresji genów oraz analizy genomu i transkryptomu; rozumie przyczyny powstawania chorób genetycznych. Wykonuje izolację plazmidu i analizę restrykcyjną, projektuje startery do reakcji PCR i dokonuje ich modyfikacji, łączy fragmenty kwasów nukleinowych, wprowadza wektory do komórek prokariotycznych i identyfikuje pozytywne klony, amplifikuje i klonuje wybrane fragmenty genów, izoluje RNA i analizuje ekspresję genów technikami jakościowymi i ilościowymi. Posiada umiejętność odpowiedniego dobierania technik analiz molekularnych do danego zagadnienia, posiada umiejętność posługiwania się podstawowymi pojęciami z zakresu genetyki molekularnej. |
|
| Wymagania wstępne: | Zaliczenie kursu Genetyka klasyczna |
|
| Forma i warunki zaliczenia: | • Egzamin pisemny w formie testu jednokrotnego wyboru. Wymagane uzyskanie ponad 50% z maksymalnej liczby punktów • Warunkiem dopuszczenia do egzaminu jest uzyskanie zaliczenia z ćwiczeń. • Warunkiem zaliczenia ćwiczeń jest zaliczenie kolokwiów, praktyczne rozwiązanie postawionego problemu badawczego oraz udział w zajęciach. |
|
| Metody sprawdzania i kryteria oceny efektów kształcenia uzyskanych przez studentów: | Znajomość omawianych zagadnień będzie sprawdzana podczas kolokwiów oraz egzaminu pisemnego. Aby zaliczyć egzamin student musi wykazać się znajomością mechanizmów replikacji DNA, traksrypcji i translacji wraz ze znajomością enzymów zaangażowanych w te procesy i mechanizmów kontrolnych. Umiejętność doboru techniki do zagadnienia oraz posługiwania się omawianymi technikami będzie sprawdzana poprzez postawienie studentów przed konkretnym problemem badawczym, który mają sami rozwiązać w trakcie praktycznych ćwiczeń. |
|
| Metody dydaktyczne: | • metody podające (wykład informacyjny) • metody problemowe (wykład problemowy, wykład konwersatoryjny), • metody praktyczne (ćwiczenia laboratoryjne, rachunkowe, metoda projektów). |
|
| Bilans punktów ECTS: | Udział w zajęciach: wykład – 10 h konwersatoria -10 h ćwiczenia – 40 h Praca własna studenta: • przygotowanie do zajęć - 15 h • przygotowanie do egzaminu – 25 h • lektura wskazanych przez prowadzącego publikacji – 20 h w sumie: 120 h |
|
| Grupa treści kształcenia: | Grupa treści kierunkowych |
|
| Pełny opis: |
Wykłady: - organizacja genomów, różnice w organizacji i kodzie genetycznym pro- i eukariontów - replikacja (różnice w replikacji u prokariota i eukariota na poziomie molekularnym, różnice w budowie enzymów) - metody badania genomów, sekwencjonowanie, sekwencjonowanie nowej generacji - transkrypcja (różnice w transkrypcji u pro- i eukariontów na poziomie molekularnym) - regulacja transkrypcji, metody badania transkrypcji - niekodujący RNA - translacja (biosynteza białek) - molekularne mechanizmy kontroli translacji Ćwiczenia: 1. Wektory stosowane w przygotowaniu konstruktów genetycznych. Plazmidy, izolacja plazmidowego DNA. Enzymy służące do manipulacji DNA (w tym zastosowanie enzymów restrykcyjnych) - 3 godziny 2. Wprowadzanie dodatkowych miejsc cięcia dla enzymów restrykcyjnych w dowolny fragment genu metodą PCR, reakcja ligacji – 3 godz. 3. Wprowadzanie plazmidowego DNA do komórek bakteryjnych. Przygotowanie komórek kompetentnych. Metody transformacji. Metody identyfikacji klonów bakteryjnych po transformacji - 6 godzin. 4. Elementy składowe konstruktów do transgenezy, konstrukty ekspresyjne, konstrukty wyłączające/wyciszające ekspresję – 4 godz. 5. Metody izolacji i analizy RNA - 6 godz. 6.Reakcja odwrotnej transkrypcji, metody badania ekspresji genów – 6 godz. 7. Analiza ilościowa metodą PCR w czasie rzeczywistym – 6 godz. 8. Samodzielne rozwiązanie problemu badawczego – 6 godz. | |
| Literatura: |
Literatura podstawowa (wybrane zagadnienia): 1) Genetyka Molekularna, pod red. P. Węgleńskiego, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2000. (Wybrane zagadnienia) 2) Podstawy biologii molekularnej, Lizabeth A. Allison, Wydawnictwa Uniwersytetu Warszawskiego, 2009. (Wybrane zagadnienia) Literatura uzupełniająca: 3) Genomy, TA. Brown, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2009. 4) Podstawy biologii komórki: wprowadzenie do biologii molekularnej, B. Alberts i in., Wydawnictwo Naukowe PWN, 1999. 5) Analiza DNA teoria i praktyka, redaktor R. Słomski, Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego w Poznaniu, 2011. | |
| Uwagi: |
III rok Igo stopnia, ścieżka indywidualnego kształcenia | |
Właścicielem praw autorskich jest Uniwersytet Jagielloński w Krakowie.